Fakultas Ilmu Ekonomi, Sastra dan Politik (FESSOSPOL) Universitas Sains dan Teknologi Jayapura, mempunyai lima program studi, yaitu: »
Fakultas Ilmu Kesehatan (FIKES) Universitas Sains dan Teknologi Jayapura, mempunyai dua program studi, yaitu: »
Fakultas Ilmu Komputer dan Manajemen (FIKOM) Universitas Sains dan Teknologi Jayapura, mempunyai empat program studi, yaitu: »
Fakultas Teknik Sipil dan Perencanaan (FTSP) Universitas Sains dan Teknologi Jayapura, mempunyai empat program studi, yaitu:: »
Fakultas Teknologi Industri dan Kebumian (FTIK) Universitas Sains dan Teknologi Jayapura, mempunyai enam program studi, yaitu: »
Lembaga Penelitian dan Pengembangan Masyarakat (LP2M) USTJ memiliki tekad untuk tak hanya membangun mutu universitas, memajukan potensi masyarakat sekitas kampus. »
Berpartisipasi dalam mencerdaskan kehidupan bangsa sesuai dengan amanat Undang-Undang Dasar Negara Republik Indonesia tahun 1945, hal demikian merupakan cerminan dari Universitas Sains dan Teknologi Jayapura (USTJ) dalam ikut serta meningkatkan kualitas pendidkan di Indonesia sejak 26 (dua puluh enam) tahun yang lalu. Sebagai salah satu institusi pendidikan tinggi swasta di Provinsi Papua yang bernaung di bawah Yayasan Universitas Sains dan Teknologi Jayapura (USTJ), memiliki ragam program bidang studi bidang teknik relatif paling lengkap dibanding perguruan tinggi lainnya di Papua.. »